症状主要为害茎秆和叶鞘，苗期至坚固期都可染病。幼苗发病，初在第一片叶与芽鞘之间有针尖大小的小斑点，以后扩展到叶鞘和叶片上，呈梭形褐边白斑并有虫粪状物。拔节期在叶鞘上形成褐色云斑，边沿清楚，病斑上有灰黑色虫粪状物，叶鞘内有一层白色菌丝。有的茎秆内也布满菌丝。叶片下垂卷曲。抽穗后叶鞘内菌丝变为灰黑色，叶鞘表面有清楚突出小斑点（子囊壳），茎基部干涸或折倒，形成枯白穗，籽粒秕瘦。
病原GibellinacerealisPass.称禾谷绒座壳，属子囊菌亚门真菌。子座初埋生在寄主表皮下，成熟后外露。子囊壳椭圆形，埋生在子座内，大小300―430×140―270（μm），长劲外露。子囊棒状，有短柄，大小118―139×13.9―16.7（μm），内有子囊孢子8个。子囊孢子梭形，双胞，黄褐色，两头钝圆，大小27.9―34.9×6―10（μm）。
传播途径发病前提以泥土带菌为主，未腐熟粪肥也可传播。病原菌在泥土中存活3年以上，小麦在出苗后即可被感染，植株间一般互不感染。田间湿度大，地温10―15℃适宜秆枯病发生。小麦3叶期前轻易抱病，叶龄越大，抗病力越强。病害行程度主要决定于泥土带菌几许。
防治方法
（1）选用抗（耐）病品种如中苏68号、2711、敖德萨3号等，各地可因地制宜选用。
（2）增强农业防治麦收时集中排除田间所有病残体。重病田实行3年以上轮播。混有麦秸的粪肥要充分腐熟或参加酵素菌进行沤制。适期早播，土温降至感染适温时小麦已跨越3叶期，抗病力加强。
（3）药剂防治用50%拌种双或福美双400g拌麦种100kg、或40%多菌灵可湿粉100g加水3kg拌麦种50kg、50%甲基硫菌灵可湿粉按种子量0.2%拌种。