小麦链格孢叶枯病症状主要为害叶片，从下部叶片向上扩散。初染病时，产生卵形至椭圆形褪绿小斑，后变黑至褐灰色，边沿黄色，湿度大时病斑上生暗色霉层，严重时叶鞘和麦穗枯萎。
病原我国报道的有AlternariatenuisNees.称链格孢。异名A.tenuissima(Fr.)Wiltsh.。均属半知菌亚门真菌。该菌常与根腐叶枯菌等混合感染或蚜虫为害后侵入为害。A.tenuis分生孢子梗直，分枝或不分枝，橄榄色或黑褐色，大小为30―110×4―7(μm)。分生孢子卵形至倒棍棒形，榄褐色，有喙，具0―6个纵隔阂，1―9个横隔阂，串生，大小为20―60×11―20(μm)。印度报道AlternariatriticinaPrasadaetPrabbu称小麦链格孢，也可引起小麦叶枯病。该菌分生孢子梗单生，分生孢子椭圆形至圆锥形，并于末端削成嘴状，单
生在顶端或形成2―4个短孢子链，大小15―90×7―30(μm)，每个孢子具横膜1―10个和纵隔阂5个。病菌生长温限为5―35℃，适温为20―24℃。
传播途径和发病前提病菌随病残体在泥土中越冬或越夏，种子上也可带菌，翌年春天形成分生孢子感染春小麦或返青后的冬小麦叶片。低洼潮湿或地下水位高的麦田发生重，一般在靠近成熟期，寄主抗性下降，该病扩散很快。
防治方法(1)施足充分腐熟有机肥，倡导施用酵素菌沤制的堆肥；采取配方施肥技术，提高小麦抗链格孢菌叶枯病的能力。(2)必要时喷洒75%百菌清可湿性粉剂600倍液或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、50%扑海因可湿性粉剂1500倍液。